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ミスマッチ/ギャップを許容 ミスマッチのみ許容 ： 塩基まで (検索する配列長の25%まで)
双方向を検索 ＋方向のみ検索 －方向のみ検索

2025-04-03 08:58:29, GGGenome : DDBJ release 134.0 (Mar, 2024)

Summary:

Results:

検索語に色がつきます（ミスマッチ・挿入欠失）。

Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 16.
CP126441.1:7616604-7616623
GTAAGAACTTACTTTCTGGCTCATCAAAAT7616604CAATGCTGATTTTGGCTTCCTTTGTGCAGCAAGCTAGTCTTTTTCTCATC
Glycine max cultivar Williams 82 chromosome 16.
CP126441.1:23937591-23937610
GTAAGAACTTACTCTCTGGCTCATCAAAAT23937591CAATGCTGATTTTGGCTTCCTTTGTGCAGCAAGCCAGTCTCTTTCTCATC
Asterias rubens genome assembly, chromosome: 1.
LR699092.1:21616957-21616976
TCTTGGGATAATCGCACACAGAAACCACAA21616957CAATGCTGATTTTGGCTTCCTGATGACAAATTCCAAACTCGGCAAGAATA
Cyberlindnera sargentensis strain SHA 17.2 chromosome IV.
CP083467.1:1283705-1283724
CTGGGTAATGAAATGAGATGGAGCCATTTG1283705GGAAGCCAAAATCAGCATTGGATTCATGTCATACTGGTCTTTGTACTTCT
Caenorhabditis uteleia genome assembly, chromosome: X.
OY752138.1:11691693-11691712
AGCATCCGGATTATAAGTATCGTCCACGCC11691693GGAAGCCAAAATCAGCATTGAAAGGTCAAAACCGACTTTCAATTGGCTTA

Data Export:

下記のフォーマットで最大100000件まで検索結果を取得できます。

Debug Info:

Redirect URI : https://gggenome.dbcls.jp/ja/ddbj/%20CAATGCTGATTTTGGCTTCC
lang : ja | db : ddbj | k : 0 | strand : | nogap : | query_string : %20CAATGCTGATTTTGGCTTCC | format : html | download : | debug : 

0.009 | 0.009 | search_start;
0.178 | 0.169 | search_plus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=CAATGCTGATTTTGGCTTCC&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=50
0.277 | 0.099 | search_minus_done; http://172.18.8.135:50400/match?q=GGAAGCCAAAATCAGCATTG&k=0&no_gap=0&offset=0&limit=47
0.278 | 0.001 | cgi_end;

GGGenome by @meso_cacase at DBCLS
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